الانتقال إلى المحتوى
سايبرتاك.
الرعاية الصحية· ٢ دقائق قراءة

إصدار هيكليات ثلاثية الأبعاد لأكثر من 2800 مركب بروتيني فيروسي بواسطة NVIDIA و Google DeepMind

تهدف هذه البيانات المفتوحة إلى مساعدة العلماء في فهم الهياكل الفيروسية لتسريع أبحاث اللقاحات والأدوية للأوبئة المستقبلية.

بقلم Cyberttakنُشر · 17:38
تصور ثلاثي الأبعاد لهيكل بروتين فيروسي
تصور ثلاثي الأبعاد لهيكل بروتين فيروسيالمصدر: Photo: vitroid / Flickr · CC BY 2.0 (cropped)

أطلقت NVIDIA بالتعاون مع Google DeepMind ومنظمات بحثية عالمية، تنبؤات هيكلية ثلاثية الأبعاد لأكثر من 2800 مركب بروتيني فيروسي. تهدف هذه الخطوة إلى تزويد الباحثين ببيانات بيولوجية أساسية لتحسين الاستعداد لمواجهة الأوبئة المحتملة في المستقبل.

استخدم الفريق نموذج AlphaFold2، وهو نموذج ذكاء اصطناعي متخصص في التنبؤ بكيفية طي البروتينات لتشكيل هيئات ثلاثية الأبعاد. ومن خلال دمج NVIDIA BioNeMo Inference Runtime، تمكن الباحثون من توسيع نطاق عملية التنبؤ لتشمل آلاف البروتينات الفيروسية. يسمح هذا للعلماء بدراسة كيفية تفاعل مجموعات البروتينات مع بعضها، بدلاً من فحص جزيء واحد فقط في كل مرة.

تعد قاعدة البيانات هذه محركاً لتوليد الفرضيات العلمية.

تتطلب الطرق التقليدية لتحديد هذه الهياكل، مثل تصوير البلورات بالأشعة السينية، سنوات من العمل المخبري المجهد. الآن، يمكن توليد هذه التنبؤات في غضون دقائق، مما يقلص الوقت اللازم لتحديد الأهداف المناسبة للقاحات أو الأدوية.

  • تحتوي قاعدة بيانات AlphaFold الآن على أكثر من 260 مليون تنبؤ لهياكل البروتينات.
  • تمثل التفاعلات المضافة حديثاً ما يقارب 30% من المعلومات الجديدة كلياً في هذا المجال.
  • أتاحت NVIDIA أيضاً مسار BioNeMo Structure Prediction Pipeline للمختبرات لتمكينهم من إجراء تنبؤاتهم الخاصة.

ورغم أن هذه البيانات تعد أداة قوية لتوليد الفرضيات العلمية، إلا أنها لا تغني عن التحقق المخبري. توفر هذه التنبؤات عالية الدقة نقطة انطلاق هامة، لكن لا يزال يتعين على العلماء إجراء تجارب فيزيائية لتأكيد هذه النماذج قبل اعتمادها في تطوير الأدوية السريرية.

المصدر: NVIDIA Blog